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独習　Pythonバイオ情報解析(実験医学別冊) [単行本] 実験医学別冊独習改訂 (実験医学別冊) Pythonバイオ情報解析〜Jupyter、NumPy、pandas、Matplotlibを理解し、実装して学ぶシングルセル、RNA-Seqデータ解析 Pythonでバイオの解析を学ぶおすすめの1冊独習Pythonバイオ情報解析

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独習　Pythonバイオ情報解析(実験医学別冊) [単行本] 実験医学別冊独習改訂 (実験医学別冊) Pythonバイオ情報解析〜Jupyter、NumPy、pandas、Matplotlibを理解し、実装して学ぶシングルセル、RNA-Seqデータ解析 Pythonでバイオの解析を学ぶおすすめの1冊独習Pythonバイオ情報解析の詳細情報

第1章この本の使い方と事前準備
1.1 Python を用いる理由
1.2 プログラミングを行うためのマシンの用意
他

第2章 Jupyter Notebook の使い方
2.1 Jupyter Notebook の基本操作
2.2 Jupyter Notebook の便利な機能
他

第3章 Python 速習コース
3.1 はじめに
3.2 関数とメソッド
他

第4章文字列処理の基本～ファイルの読み書き，正規表現
4.1 文字列処理
4.2 ファイルの読み書き
他

第5章 Biopython を用いた塩基配列データの扱い方～オブジェクト指向入門
5.1 クラスを利用したプログラミング
5.2 Biopython を使った配列ファイルの読み書き
他

第6章 pandas はじめの一歩～表形式データの扱い方
6.1 準備
6.2 Series
他

第7章 RNA-Seq カウントデータの処理～pandas 実践編
7.1 準備
7.2 データファイルの読み込みとアノテーション
他

第8章データの可視化～Matplotlib，Seaborn を用いたグラフ作成
8.1 解析環境のセットアップおよびデータの準備
8.2 Matplotlib ライブラリの使い方
他

第9章統計的仮説検定～RNA-Seq データを用いた検定の基本からモデル選択まで
9.1 必要ライブラリのimport
9.2 基本的な用語や概念
他

第10章シングルセル解析1 ～テーブルデータの前処理
10.1 はじめに
10.2 データの前処理
他

第11章シングルセル解析2 ～次元削減
11.1 データ読み込み
11.2 主成分分析
他

第12章シングルセル解析3 ～クラスタリング
12.1 データ読み込み
12.2 階層的クラスタリング
他

付録A NumPy 入門
A.1 NumPy のimport
他

付録B Scanpy を使ったシングルセル解析
B.1 Scanpy のimport
他